ÖZET
Sonuç:
Özellikle hastalardan elde edilen klinik örneklerde muhtemelen daha az sayıda parazit bulunması nedeniyle, LRV’nin saptanabilmesi amacıyla duyarlılığın artırılması önemlidir. Virüsün varlığı ve yükü, klinik bulgular ile parazitin patojenliği arasındaki ilişkiyi anlamaya yardımcı olabilecek ve bu da tedavi aşamasında değişikliklere yol açabilecektir.
Bulgular:
Klasik kit prosedüründen farklı olarak 95 °C’de ön denatürasyon adımının eklenmesi, duyarlılığın arttığını gösteren daha düşük Ct değerleri ortaya çıkarmıştır. Farklı parazit dilüsyonları ile de benzer sonuçlar gözlenmiştir.
Yöntemler:
Bu çalışmada, LRV2+ 3 L. major, 2 L. tropica ve kontrol olarak L. major (MHOM/SU/73/5- ASKH) suşları kullanılmıştır. Total RNA izolasyonu 108, 105 ve 103 sayılarına ulaşan Leishmania promastigotları kullanılmıştır. cDNA sentezinden önce numuneler, kit prosedüründen farklı olarak 95 °C’de 2 dakika denatüre edilmiştir. qPCR, SYBR Green Master karışımında seyreltilmiş 0,5 mM primerler (LRV F-HR/LRV R-HR) kullanılarak yapılmıştır.
Amaç:
Leishmania RNA virüsü, ilk olarak yeni dünya Leishmania türlerinde tespit edilmiştir. Son çalışmalar, Türkiye’deki L. major, L. tropica izolatları dahil olmak üzere, eski dünya Leishmania türlerinde de Leishmania RNA virüsü 2’nin (LRV2) varlığını göstermiştir. Bu çalışmada LRV2’nin tespiti için cDNA hazırlama protokolünün denatürasyon aşamasında yapılan bir modifikasyon ile qPCR’nin duyarlılığının artırılması amaçlanmıştır.