ÖZ

Amaç

Günümüzde sıtma, 619.000 ölümle en çok ölüme neden olan paraziter hastalık olmaya devam etmektedir. Sıtmaya neden olan <em>Plasmodium</em> parazitlerinin hem insanlarda hem de dişi Anopheles sivrisineklerinde ayrı yaşam döngüleri vardır ve bu süreç boyunca çeşitli biçimlerde var olurlar. Hastalığın gözlemlenmesinin temel nedeni, merozoitlerin eritrositleri istila ederek varlıklarını sürdürmeleridir. Mevcut ilaçlar parazitin hemoglobini sindirme yeteneğini etkiler. İlaç direnci de bu süreçte yer alır. Bu çalışmada, ilaç direncinden kaçınmak için yeni ilaç adayı molekülleri geliştirmeye odaklanılmıştır. İlaç direncinden kaçınmak için amaç, merozoitlerin eritrositleri istila etmesini önlemekti.

Yöntemler

Merozoitlerin eritrositlere invazyonu birkaç aşamadan oluşur: Tutunma, deformasyon, apikal bağlantı oluşumu ve sıkı bağlantı oluşumu. Bu amaçla, MSP1, pvDBP, phRH5, AMA1 gibi istilacı proteinler ile adaylar arasında kenetleme hesaplamaları yapılmıştır. Malaria box setinden elde edilen adaylar, fizikokimyasal özelliklerini belirlemek için Spartan’14 programında konformasyonel tarama ve geometri optimizasyonuna tabi tutulmuştur. AutoDock Vina’dan elde edilen sonuçlara göre, her protein için bağlanma afiniteleri ile adayların hesaplanan fizikokimyasal parametreleri arasındaki ilişkiyi incelemek için çoklu regresyon analizleri yapıldı.

Bulgular

Dört farklı protein için incelenen 200 molekülün regresyon çalışmasında DBP için 108, MSP1 için 96, AMA1 için 90 ve RH5 için 96 molekül dahil edilmiş olup tüm proteinler için 21 tane ortak molekül olduğu gözlenmiştir.

Sonuç

Yirmi bir molekül çalışılan proteinlerle korelasyon gösterdi. Bu moleküller arasında, bağlanma afiniteleri, fizikokimyasal özellikleri ve SwissADME değerleri açısından MMV019074, MMV019662 ve MMV665881 aday ilaç öncüleri olarak önerildi.