<i>Culiseta longiareolata</i>’daki Sitokrom Oksidaz I ve Internal Transcribed Spacer 2’nin Moleküler Karakterizasyonu
PDF
Atıf
Paylaş
Talep
P: 191-196
Aralık 2020

Culiseta longiareolata’daki Sitokrom Oksidaz I ve Internal Transcribed Spacer 2’nin Moleküler Karakterizasyonu

Turkiye Parazitol Derg 2020;44(4):191-196
Bilgi mevcut değil.
Bilgi mevcut değil
Alındığı Tarih: 01.04.2020
Kabul Tarihi: 09.06.2020
Yayın Tarihi: 02.12.2020
PDF
Atıf
Paylaş
Talep

ÖZET

Amaç:

Sivrisinekler arasında Culiseta longiareolata, Batı Nil humması da dahil olmak üzere kuş sıtması, tularemi ve arbovirüs enfeksiyonlarının bulaşmasında önemli bir rol oynamaktadır. Bu çalışma, Cs. longiareolata’nın Sitokrom Oksidaz I (COI) ve Internal Transcribed Spacer 2 (ITS2) fragmanlarını karakterize etmek için İran’ın kuzeybatısında yapıldı.

Yöntemler:

Cs. longiareolata’nın altı popülasyonundaki COI ve ITS2 fragmanları amplifiye edildi, sekans dizimi yapıldı ve analiz edildi. Filogenetik analiz için evrimsel tarih, Tamura-Nei tabanlı maksimum olabilirlik yaklaşımı kullanılarak tahmin edildi.

Bulgular:

On üç sekans (ITS 2 için 6 ve COI için 7) elde edildi ve Genbank’ta saklandı. Filogenetik analiz, mevcut çalışmadaki Cs. longiareolata’nın COI dizilerinin, dünyanın diğer bölgelerinden gelen aynı türlerle birlikte kümelendiğini gösterdi. Buna ek olarak, çalışmadaki 6 Cs. longiareolata popülasyonunun ITS2 dizileri ve genbank formundan elde edilen diziler, tür içi varyasyonlara rağmen, kabul edilebilirön yükleme değerlerine sahip ayrı bir diziye yerleştirilmiştir.

Sonuç:

Cs. longiareolata popülasyonları arasında ITS2 ve COI’ya bağlı olarak dikkate değer çeşitlilikte genetik varyasyon bulunmuştur. Bu sonuçlar, Cs. longiareolata’nın farklı popülasyonlarının daha büyük örneklem boyutlarıyla daha geniş ölçekte yapılacak daha ileri çalışmalar için bir başlangıç olabilir. Bu tür çalışmalar yapmak, bu türlerin kesin sınıflandırmasını belirleyebilir.

References

1
Foster WA, Walker ED. Mosquitoes (Culicidae). In: Mullen G, Durden L, editors. Medical and veterinary entomology. London: Elsevier; 2019.p.261-325.
2
Azari-Hamidian S, Norouzi B, Harbach RE. A detailed review of the mosquitoes (Diptera: Culicidae) of Iran and their medical and veterinary importance. Acta Trop 2019; 194: 106-22.
3
Brahim M, Quakid ML. Responses of the four larval stages (L1 to L4) of the avian malaria vector culiseta longiareolata exposed to spinosad (naturally derived insecticide). Adv Anim Vet Sci 2019; 7: 599-603.
4
Carvalho CL, Zé-Zé L, Duarte EL, Núncio MS, De Carvalho IL. Screening of mosquitoes as vectores of francisella tularensis in Portugal. 7th International Conference on tularemia, Breckenridge, Colorado, 2012.
5
Hubálek Z, Halouzka J. West Nile fever--a reemerging mosquito-borne viral disease in Europe. Emerg Infect Dis 1999; 5: 643-50.
6
Hebert PD, Cywinska A, Ball SL, deWaard JR. Biological identifications through DNA barcodes. Proc Royal Soc B 2003; 270: 313-21.
7
Collins FH, Paskewitz SM. A review of the use of ribosomal DNA (rDNA) to differentiate among cryptic Anopheles species. Insect Mol Biol 1996; 5: 1-9.
8
Paskewitz SM, Wesson DM, Collins FH. The internal transcribed spacers of ribosomal DNA in five members of the Anopheles gambiae species complex. Insect Mol Biol 1994; 2: 247-57.
9
Alam MT, Bora H, Das MK, Sharma YD. The type and mysorensis forms of the Anopheles stephensi (Diptera: Culicidae) in India exhibit identical ribosomal DNA ITS2 and domain-3 sequences. Parasitol Res 2008; 103: 75-80.
10
Kampen H. The ITS2 ribosomal DNA of Anopheles beklemishevi and further remarks on the phylogenetic relationships within the Anopheles maculipennis group of species (Diptera: Culicidae). Parasitol Res 2005; 97: 118-28.
11
Shepard JJ, Andreadis TG, Vossbrinck CR. Molecular phylogeny and evolutionary relationships among mosquitoes (Diptera: Culicidae) from the northeastern United States based on small subunit ribosomal DNA (18S rDNA) sequences. J Med Entomol 2006; 43: 443-54.
12
Khoshdel-Nezamiha F, Vatandoost H, Oshaghi MA, Azari-Hamidian S, Mianroodi RA, Dabiri F, et al. Molecular characterization of mosquitoes (Diptera: Culicidae) in Northwestern Iran by using rDNA-ITS2. Jpn J Infect Dis 2016; 69: 319-22.
13
Bagheri M, Terenius O, Oshaghi MA, Motazakker M, Asgari S, Dabiri F, et al. West Nile virus in mosquitoes of Iranian wetlands. Vector Borne Zoonotic Dis 2015; 15: 750-4.
14
Azari-Hamidian, S. Checklist of Iranian mosquitoes (Diptera: Culicidae). J Vector Ecol 2007; 32: 235-42.
15
Silver JB. Mosquito ecology: field sampling methods. New York: Springer; 2008.
16
Azari-Hamidian S, Harbach RE. Keys to the adult females and fourth-instar larvae of the mosquitoes of Iran (Diptera: Culicidae). Zootaxa 2009; 2078: 1-33.
17
Collins FH, Mendez MA, Rasmussen MO, Mehaffey PC, Besansky NJ, Finnerty V. A ribosomal RNA gene probe differentiates member species of the Anopheles gambiae complex. Am J Trop Med Hyg 1987; 37: 37-41.
18
Simon C, Frati F, Beckenbach A, Crespi B, Liu H, Flook P. Evolution, weighting, and phylogenetic utility of mitochondrial gene sequences and a compilation of conserved polymerase chain reaction primers. Ann Entomol Soc Am 1994; 87: 651-701.
19
Tamura K, Nei M. Estimation of the number of nucleotide substitutions in the control region of mitochondrial DNA in humans and chimpanzees. Mol Biol Evol 1993; 10: 512-26.
20
Tamura K, Stecher G, Peterson D, Filipski A, Kumar S. MEGA6: molecular evolutionary genetics analysis version 6.0. Mol Biol Evol 2013; 30: 2725-9.
21
Holmes S. Statistics for phylogenetic trees. Theor Popul Biol 2003; 63: 17-32.
22
Saitou N. 10 Statistical methods for phylogenetic tree reconstruction. Handbook Of Statistics 1991; 8: 317-46.
23
Vázquez A, Sánchez-Seco MP, Palacios G, Molero F, Reyes N, Ruiz S, et al. Novel flaviviruses detected in different species of mosquitoes in Spain. Vector Borne Zoonotic Dis 2012; 12: 223-9.
24
Aranda C, Sánchez-Seco MP, Cáceres F, Escosa R, Gálvez JC, Masià M, et al. Detection and monitoring of mosquito flaviviruses in Spain between 2001 and 2005. Vector Borne Zoonotic Dis 2009; 9: 171-8.
25
Lilja T, Eklöf D, Jaenson TGT, Lindström A, Terenius O. Single nucleotide polymorphism analysis of the ITS2 region of two sympatric malaria mosquito species in Sweden: Anopheles daciae and Anopheles messeae. Med Vet Entomol 2020; 34: 364-8.
26
Pashaei S, Sedaghat MM, Dabiri F, Vahedi M, Afshar AA, Chavshin AR. Molecular Analysis of ITS2 Fragment among Anopheles maculipennis Species Complex, West Azerbaijan Province, Iran. J Kerman Univ Medical Sci 2017; 24: 220-8.
27
Motoki MT, Wilkerson RC, Sallum MAM. The Anopheles albitarsis complex with the recognition of Anopheles oryzalimnetes Wilkerson and Motoki, n. sp. and Anopheles janconnae Wilkerson and Sallum, n. sp.(Diptera: Culicidae). Mem Inst Oswaldo Cruz 2009; 104: 823-50.
28
Laurito M, de Oliveira TMP, Almirón WR, Sallum MAM. COI barcode versus morphological identification of Culex (Culex)(Diptera: Culicidae) species: a case study using samples from Argentina and Brazil. Mem Inst Oswaldo Cruz 2013; 108(Suppl 1): 110-22.
29
Sallum MAM, Foster PG, Dos Santos CLS, Flores DC, Motoki MT, Bergo ES. Resurrection of two species from synonymy of Anopheles (Nyssorhynchus) strodei Root, and characterization of a distinct morphological form from the Strodei complex (Diptera: Culicidae). J Med Entomol 2010; 47: 504-26.
30
Bourke BP, Oliveira TP, Suesdek L, Bergo ES, Sallum MAM. A multi-locus approach to barcoding in the Anopheles strodei subgroup (Diptera: Culicidae). Parasites Vectors 2013; 6: 111.
31
Rozo-Lopez, P, Mengual X. Mosquito species (Diptera, Culicidae) in three ecosystems from the Colombian Andes: identification through DNA barcoding and adult morphology. Zookeys 2015; 39-64.
32
Ashfaq M, Hebert PDN, Mirza JH, Khan AM, Zafar Y, Mirza MS. Analyzing Mosquito (Diptera: Culicidae) Diversity in Pakistan by DNA Barcoding. PLoS ONE doi: 10.1371/journal.pone.0097268
2024 ©️ Galenos Publishing House